mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCGATGCTTGTATGCTACTCC AGCCCAGGCAGCACAGAGAA CACCAAGGGAGCCCAGGCAGCACAGAGAAGGTGGATTCTGCACACAAACACTCGGCGCTGTAGCCGTGGCCGAGTGTGGGATGCTGAGGTCTAGACTCCTTTCGATGCTTGTATGCTACTCCCAGGAATGCC 5 2 3' arm Taeniopygia_guttata mirbase 100 gga-mir-1559 0.0000000000001 -45.9 ..((..(((((..((.((((((..((((.(((((((((.(((..(..(((((((((((....))....))))))))).)..))).)).)))))....))))))..))).))).))...))))).))...... (-45.90)