mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATCCCTTACTCACGTGAGCAGTC CTACTCGGTGAGTAAGGATCG GGTAGACAGGCCTGATCCTGCATCCCTTACTCACGTGAGCAGTCGTCTCTATGTCAAAGGGACTACTCGGTGAGTAAGGATCGCAGGATTGGGACCACTACC 1 2 5' arm Taeniopygia_guttata mirbase 100 gga-mir-1729 6e-18 -52.4 (((((...((((..(((((((((((.((((((((.((((.((((.(((.........))))))).)))))))))))))))).)))))))..)).)).))))) (-52.40)