mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGGTCCAACCTCACATGTCCT GATATATGTGGTCAGACCTATC GAGGTTAGATGGCACTTTGGGGTTTCCTTCTGAGGAATATCAGACCTGTGGGAAAGGTCCAACCTCACATGTCCTGTATAGAATAAAGAGGGATATATGTGGTCAGACCTATCCCACAAGTCCTGTATTCTTACTCAAGTTCAGAGACCTTGACATGCCATCTGATCTT 5 0 5' arm Taeniopygia_guttata mirbase 100 gga-mir-2188 5e-81 -79.54 ((((((((((((((..(..(((((((...(((((((((((..(((.(((((((.(((((..(((.((.(((((((..............))))))).)).)))..))))).))))))).)))..))))))...))).))....)))))))..)..)))))))))))))) (-79.54)