mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGCTTCTGGACTTTGCATC TGCAAAGTCCAACAGCTTAGC GTGCGAGTACTTCCAGCTGCTTTAGTGCAAAGTCCAACAGCTTAGCCTGAATAGTCTTCTCTGACAGCTCCAGCTAAGCTTCTGGACTTTGCATCAAAGTGGCTGTGCACTCACAT 3 0 3' arm Taeniopygia_guttata mirbase 100 100 -56.5 (((.((((.(...((((..((((.((((((((((((..((((((((..((...(((......)))...))..))))))))..)))))))))))).))))..)))).).)))).))) (-56.50)