mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CGCCAAAGGAGAGCTGCCCTA GGGCTACTCTCTATTGGCATG TGGTGTAAGGGAAATAGTGATAGGGCTACTCTCTATTGGCATGTGGTTATATGTTTGAGCTGACACGCCAAAGGAGAGCTGCCCTATTACTGTCTCCGCTTAATC AAAATCAGAAGTAGAAAAAATGAGAAAGATGCGCAAGGTGGTGTAAGGGAAATAGTGATAGGGCTACTCTCTATTGGCATGTGGTTATATGTTTGAGCTGACACGCCAAAGGAGAGCTGCCCTATTACTGTCTCCGCTTAATCTTAATCTGAGAAGCTTTACGAATACTTGATTCTATAGATTATCAAATAGCGTCTACATTTCTACTAGAAGAGTTGTAGAGAATTCATACCAATGCTAGTTTTAAGCTGCTTTTATAGGAACATTGCATGGATGGAATTCTTATGTTGACTCACTTCTTCTTCATCTCCTATGTACAAGAGCCTAGACCCATTGCAGTTTTGCAGTGACGAGTCCAATTTTAAC 4 0 3' arm Solanum_melongena mirnest 100 sly-MIR399 8.0E-5 -46.8 .....(((((((.(((((((((((((..((((((.(((((.(((((((.........)))).))).))))).))))))..))))))))))))).))).))))... (-46.8)