mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGGAGCGAGGAAGGGGATGGGA CCATCCCCTGCCTCTCTTCTCC GCCCTGGGAAGGGGAGGAGCGAGGAAGGGGATGGGATGGGCTAACCAGGGTCCATCCCCTGCCTCTCTTCTCCCTTTCCTGGGGC 3 0 5' arm Taeniopygia_guttata mirbase 100 100 -68.9 ((((..(((((((((((((.((((.((((((((((.(((.....)))...)))))))))).)))).)))))))))))))..)))) (-68.90)