mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAAAGGGATTTTTGGGATGAGA ACTTCCCAGCATCCCTGTTTCC CCAGGAGGTTTTGGGGTGGCCTCACCTCTCAGCACGGATTTGGAATTGAGTCACTGGGTGACTTCCCAGCATCCCTGTTTCCTTTGGATCTCGGGAGGAAAAGGGATTTTTGGGATGAGATTCAGTGTCGAGCTCAAAGGATGTCTTGGTGGAGGAGGTGGCCGGATCCTGAGCGCTGCTGG 4 2 3' arm Taeniopygia_guttata mirbase 100 100 -79.5 ((((.((((((.(((.(((((((.((((.((.((.((((......((((((((((((((..(.((((((.((((((.((((((((.(....).))))))))))))))..)))))).)..))))))))....)))))).....)))))).)))))).)).)))))..))).)))).)).)))) (-79.50)