mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGACAGAAGAGAGTGAGCACA TGCTCACTTCTCATTCTGTCAGC AGAATCAAGACTGACAGAAGAGAGTGAGCACACGCAGTCAAATTGTATAACGATTTATACAATTGTCATTTGCGTGTGCTCACTTCTCATTCTGTCAGCTCTCTCAA TGTACATACCCTGCCTACTGCATGGGATAAAAAAATGAGAGAATTTTATTTATATAAATATCTTTTTTTACTACTATATCTACTAGTACTAAAGATGTGATTTTGTTCATTACAACTAAAAGATATATATATATATATCCATATTACCATATATAACTGTTTTGTGAGTTCTGAATCAAAAGAATACATTTTGTAGTATATATAATATATTTATACAAGATATTGAATTCTGTTGAATTCATAGAGATGTTAATTTCTTGGAGTATGTTCAATTTTATTAGGGTTTTTGATCTTATCAAACGAGTTTGTGTCTTTGATTTCAGATCTGACTAGGGTGAAGGGAAGAGACAGGAAAGAGAAAGGAGAGGGGAGCGCAGAGAGAATCAAGACTGACAGAAGAGAGTGAGCACACGCAGTCAAATTGTATAACGATTTATACAATTGTCATTTGCGTGTGCTCACTTCTCATTCTGTCAGCTCTCTCAATACTTATGTTTCCCCCTTTCTTTTTATCTTTTCGATCCTTCCACCATTGAGAAGTAGAAATAGTTGATTTTATAATAAATATATATATGTATAGGATTCTTTTGATGAAAGTTTATGGAAACTTATACAATGACACTTGCTGAAGCAGCATAAATGTAAGGATATTTGTAATTTATTTTTAAAAAAAAATTATGTTTGTTTAGTTTGTTTCTTGTCCTGTGTTAAGCTAACATCTGTCTAAACAATAAAAAAAAGTTTATATGACAGACTGATAGACATGACATTTCAACACACACAAAAAATCTTGT 0 2 5' arm Solanum_melongena mirnest mir-156 1.0E-7 vvi-MIR156d 9.0E-11 -50.4 .......((((((((((((((((((((((((((((((...((((((((((....)))))))))).....)))))))))))))).)))).))))))))).)))..... (-50.4)