mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GATCCCTTTGGATGCCTCCTT GGAGGAGTCCAAAGGGATAGC GTAGCTCCAAAAGGAGGAGTCCAAAGGGATAGCATGATCCAATTCAATATTTTTTTTATGTAATAGATTATATGTTGTTTGGATACTTCAAAATTATGCACAATACGTGTTGAATCCTTCAAAAGAATAGTATATTTTTAAAAGATCTAATCGATACAGGCCTGACAACATTTTGGAGAGTTCAAGCAACATAATAAATAGAAAGTTATATTACTTGAACTCTCACAAAAAAAAATATTATTGTATCCATGTTAAACCTTCCAAAAATACAATATCTTGAAGAATTTAACATGTACCTGTCGATATTCTTGAAAAATCTGAACAACGTATATAGAGATTGGATCAATGCGATCCCTTTGGATGCCTCCTTAAGTTGCTT CCAAATATCCCTAAAATTTTATAAATCTGTGGTGATTGGAGATAACAGATATTTGAACAATAAAATAATTGAGATACACACAAACTGATATAAAAAAGAAATTGATTAATGTGTGCTTCCAATTGGACTTACATTTTCTCTTGTGATTTTGCTTCACATTGAAATGGTTTCATCTACCATCATTGATGTTTCTTTGCTATTCATCACATCTCCAAGTTATTAGTAGCTCCAAAAGGAGGAGTCCAAAGGGATAGCATGATCCAATTCAATATTTTTTTTATGTAATAGATTATATGTTGTTTGGATACTTCAAAATTATGCACAATACGTGTTGAATCCTTCAAAAGAATAGTATATTTTTAAAAGATCTAATCGATACAGGCCTGACAACATTTTGGAGAGTTCAAGCAACATAATAAATAGAAAGTTATATTACTTGAACTCTCACAAAAAAAAATATTATTGTATCCATGTTAAACCTTCCAAAAATACAATATCTTGAAGAATTTAACATGTACCTGTCGATATTCTTGAAAAATCTGAACAACGTATATAGAGATTGGATCAATGCGATCCCTTTGGATGCCTCCTTAAGTTGCTTTCAAAATCAAGAAAAATTATCTCCAAATCTTCTTCATCATCTTCTTGAAAGTTCAAAATTTTTA 2 0 3' arm Solanum_melongena mirnest 100 mtr-MIR393 0.000000000005 -109.6 ((((((....(((((((.((((((((((((.(((((((((((((........................((((((((((((((((..((((((((..((.(((.((((((((((((.(((((..(((((.((((.(((............((.(((((((...........((((((((((((((((.((.(((((.........))))).)).))))))))))).)))))..........))))))).))............))).)))).)).)))))))).))))))))))))..)))))..))).)))))..))))))))))))))))....))))))))).)))).)))))))))))).))))))).)))))).. (-109.6)