mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAATGTAAAGAAGTATGTA CATACTTCTTTATATGCCCATA CATACTTCTTTATATGCCCATATGGACCTGCTAAGCTATGGAATGTAAAGAAGTATGTA 3 1 3' arm Canis_familiaris mirbase mir-1 4e-24 eca-mir-1-2 8e-28 -22.4 (((((((((((((((..((((((((.....)))...))))).))))))))))))))).. (-22.40)