mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAAGACTAGTGATTTTGTTGT AACAAGTCACAGCTTCCTCA GAGTGGTTGTGGTCTAGTGCTGTGTGGAAGACTAGTGATTTTGTTGTTCTGATGTACTATGACAACAAGTCACAGCTTCCTCATAGCG 1 3 5' arm Canis_familiaris mirbase mir-7 4e-28 ppy-mir-7-3 2e-35 -31.7 ..................((((((.(((((.((.(((((((.((((((.((......)).)))))))))))))))))))).)))))). (-31.70)