mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAAGGTGCATCTAGTGCAGATA CTGCCCTAAGTGCTCCTTCTGGC GTGCTTTTTGTTCTAAGGTGCATCTAGTGCAGATAGTGAAGTAGATTAGCATCTACTGCCCTAAGTGCTCCTTCTGGCATAAGAAGTTATGT 4 3 5' arm Canis_familiaris mirbase 100 ssc-mir-18a 3e-47 -27.3 ..(((((((((.((((((.(((..(((.((((.(((((..(.....)..)).))))))).)))..))).)))..))).)))))))))..... (-27.30)