mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AAGCTGCCAGTTGAAGAACTGT AGTTCTTCAGTGGCAAGCTTTA AGTTCTTCAGTGGCAAGCTTTATGTCCTGACCCAGCTAAAGCTGCCAGTTGAAGAACTGT 2 2 3' arm Canis_familiaris mirbase mir-22 4e-27 eca-mir-22 2e-28 -25.9 (((((((((((((((.((((((.((.........))))))))))))).)))))))))).. (-25.90)