mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCACCATTTGAAATCAGTGTT AGCTGGTTTCATATGGTGGTTTAGA AGCTGGTTTCATATGGTGGTTTAGATTTAAATAGTGATTGTCTAGCACCATTTGAAATCAGTGTT 4 2 3' arm Canis_familiaris mirbase mir-29 6e-23 eca-mir-29b 2e-31 -24.22 .((((((((((.((((((..((((((.............)))))))))))).))))))))))... (-24.22)