mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GAATCTTGATGATGTTGCATC TGCAGCATCATCAAGATTCCC AGGAGAGTCATATGTTAGATGATGCAGCATCATCAAGATTCCCAAAAGAGAAGAGAAGAGATTTGAACTATATATCCAATATTTATCCTAAATATCTTTAATATAACATAATTCCCCCTTCAAGTTTTGTGAATCTTGATGATGTTGCATCCTCAAACACTGACTGATAA ATACTAAACAAGAGATATATATTGATTAATTCTTTTGTTTCAAATAAAAGTACATGTTCTTTCGACATCTCCTAGTTTGTCACTGGTTTTCTCTTTCTCAAAAAGAAAAAGTTGAAATCCAATCTTGATGCACCTTAAGACCACCACTATGACTTGCTGCTTAGAAGGAGAGTCATATGTTAGATGATGCAGCATCATCAAGATTCCCAAAAGAGAAGAGAAGAGATTTGAACTATATATCCAATATTTATCCTAAATATCTTTAATATAACATAATTCCCCCTTCAAGTTTTGTGAATCTTGATGATGTTGCATCCTCAAACACTGACTGATAAAGATCAAAACTTTAATTTGAATATGATCATTAATCTTTAATCATAGGCAAAGAACAAGAGAAAACCCTATTCTTGGGAGTGGCTAAATGACATGAAAAAGTATTAAA 0 0 3' arm Solanum_melongena mirnest mir-172 3.0E-6 tcc-MIR172c 3.0E-8 -48.3 .....(((((..((((.((.(((((((((((((((((((((.(((((..((((.(((......((...(((((.....(((((((...))))))).....))))).))...)))...))))...))))).))))))))))))))))))))).)).)))).)))))..... (-48.3)