mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTGCATTGCTGTTGCATTGC AGTGCCTCGGCAGTGCAGCCC GCGGGCGGCCCCGCGGTGCATTGCTGTTGCATTGCACGTGAGTGACGCGGGTGCAGTGCCTCGGCAGTGCAGCCCGGAGCCGGCCCCTGGCACC 2 1 5' arm Canis_familiaris mirbase mir-33 6e-24 mml-mir-33b 1e-43 -57.3 (((((((((.(((.((((((((((((..(((((((((.((.......)).)))))))))..)))))))))).))))).))).))))...))... (-57.30)