mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCAAATGCTCAGACTCCTGT GGATGTTTGAGCATGTGCTA TGTGCATCGTAGTCAAATGCTCAGACTCCTGTGGTGGCTGCTCATGCACCACGGATGTTTGAGCATGTGCTACGGTGTCTA 4 0 5' arm Canis_familiaris mirbase mir-105 6e-30 bta-mir-105a 9e-41 -43.4 ...(((((((((.((.((((((((((..((((((((.(.......)))))))))..)))))))))).)))))))))))... (-43.40)