mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGCAGCATTGTACAGGGCTAT AGCTTCTTTACAGTGTTGCCTTG AGCTTCTTTACAGTGTTGCCTTGTGGCATGGAGTTCAAGCAGCATTGTACAGGGCTAT 3 2 3' arm Canis_familiaris mirbase mir-103 6e-26 xtr-mir-107 3e-27 -22.1 ((((.((.(((((((((((.(((.(((.....))))))))))))))))).)))))).. (-22.10)