mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGCACTGCCTCTTCCCTGGCT ACGGGGACGAGACAGAGCATG AATATGGTGTGGAGTGGATAGACGGGGACGAGACAGAGCATGAGATGTGCAATTTTACTTGCCCATTCCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCTCTCCTCTCCCAACAATCC ATTGTCAATTTTAAAAAAACAAAACCATTCATCTTTCTTTTTTTCCCCTCCAGATAGAAGGAATGTTAAAAGCATGGGTAATGAAGTCTCTATTGAGGTAAAATATGGTGTGGAGTGGATAGACGGGGACGAGACAGAGCATGAGATGTGCAATTTTACTTGCCCATTCCATGCACTGCCTCTTCCCTGGCTCTCCTCTCCCAACAATCCCTCCTTTTCTCCCCTTTTATTTCTCTGTCTATAGCTTTATGATGTCCCAGAACTCGAAAAAAAAAGAAGATAATTGCTTAAGTAAGAAATGGTCATAGTCGATAACATTATTTGATGGGGCTAGACGACTATGGACCAGCCTGCATTAGACCACAAGAACATTTGTTCGTTGTGACGTATGCAAGATTTTGTACAAGCATGTACAGTCACAATTTATGGTGGTTTAAAGTTTTATTTCCCATCTAACTTGGTATTTGCAATTGTTTTATTTTCGAGCTTTATCCACTTATTAATACACATATATTGGTTTT 4 0 3' arm Solanum_melongena mirnest MIR408 0.000002 csi-MIR408 0.00000002 -42.9 ....((.((.((((.(((.((.((((((.(((.(((.(((((.((((.((((......)))).)))).))))).))).))).)))))).)).))).)))))).)).... (-42.9)