mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTCATCATCATCATCTTCA ATGATGATGATTTGAAATCG CTGTATATGATGATGGTTGTTCTGATTGTTGTTATGGTGATGATGATGATGATTTGAAATCGACGACCCTCCCATCGTCGCCGGCGCCGGATTCGGCGGCGGCAACAACCTTGTACTAGCTGAAACAACAACGTTTGTTGTTGTCGTTATCGTCGTCGTCGTTGTCTCTTCATCATCATCATCTTCATCATCGTTTACACTTTCTTCTGAACTATCATCTCCACCA GTCCATTAGGCTTAATTTTTTTTCTGACTGAAACATTAGAAGAAGATGGAGATACAGGAACTGCCGGCGATGGTGAAGTAGCCGGAATGTTCTGTTGTCCCGCCAGTGAAGCTGATGACACTTGCTGATGAATTTGGTCTCCGGTAACAACACCACTGTTACCACCACCACCACTACTCCCAGAAATCCAATCATGCGACCTCTTTGTAGATGCAGAACGAGCTTTTCTTGGAACGGGAACACCAATCATTTCATCACCAGTTTTCCACACAGGCGCTGATGCTCTATAAACCTTTCCACCAACATTTGGTGGATAATTTTTCCGAGGCTGTATATGATGATGGTTGTTCTGATTGTTGTTATGGTGATGATGATGATGATTTGAAATCGACGACCCTCCCATCGTCGCCGGCGCCGGATTCGGCGGCGGCAACAACCTTGTACTAGCTGAAACAACAACGTTTGTTGTTGTCGTTATCGTCGTCGTCGTTGTCTCTTCATCATCATCATCTTCATCATCGTTTACACTTTCTTCTGAACTATCATCTCCACCATCTTCCCCACCTCTGTGCATCATCAATCTATCACCTCTTCTTCTTTTACTCCGACTTGACCTATCTCTATCTCTAATATCCCTCTCTCTAATAATATCCCTTTCTCTATCTCGTTCTCTGTCTCTCTCCCTTTCCCGA 4 1 3' arm Solanum_melongena mirnest 100 100 -70.5 .......((..((((((.((((.((..((.((.((((((((((.(((((((((.((((...(((((........)))))((((.(((((....))))).)))).(((((..((.((((((....((((((((....)))))))).))))..))...))..)))))...))))..))))))))).))))))))))..))))..))....)))).))))))..))... (-70.5)