mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AACACTGTCTGGTAAAGATGG ATCTTCCAGTACAGTGTTGG GCCGGCTCTGGGTCCATCTTCCAGTACAGTGTTGGATGGTCTAGTCACGAAGCTCCTAACACTGTCTGGTAAAGATGGCCCCCGGG 0 3 3' arm Canis_familiaris mirbase mir-8 9e-23 mml-mir-141 9e-32 -41.2 .((((....(((.(((((((((((.(((((((((((...((.......))...))).))))))))))))..)))))))))))))). (-41.20)