mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTTGGCAATGGTAGAACTCACACT TGGTTCTAGACTTGCCAACTA GCTTGCCTCCCGCCGTTTTTGGCAATGGTAGAACTCACACTGGTGAGGTAATGGGATCCGGTGGTTCTAGACTTGCCAACTATGGTGCGAGG 2 5 5' arm Canis_familiaris mirbase mir-182 1e-31 bta-mir-182 1e-40 -36.74 .....((((.((((((..(((((((.(.((((((...((((((..............))))))))))))..))))))))..)))))).)))) (-36.74)