mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CATCCCTTGCATGGTGGAGGGT CCTCCCACATGCAGGGTTTGCA TGCTCCCTCTCTCACATCCCTTGCATGGTGGAGGGTGAGCTTTTTGAAAACCCCTCCCACATGCAGGGTTTGCAGGATGGTGAGCC 5 0 5' arm Canis_familiaris mirbase mir-188 2e-39 mml-mir-188 2e-41 -39.8 .((((((..(((..((..(((((((((..((((((....(.....).....))))))..)))))))))..))..))).)).)))). (-39.80)