mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure ATAAGACGAGCAAAAAGCTTGT GAGCTTTTGGCTCGGGTTATAC ACGCATGAGCTTTTGGCTCGGGTTATACCTGATGCTCACGTATAAGACGAGCAAAAAGCTTGTTGGTCA 5 0 3' arm Canis_familiaris mirbase mir-208 1e-21 eca-mir-208a 1e-27 -27.6 .((.(..(((((((.(((((..((((((.((.....)).))))))..))))).)))))))..))).... (-27.60)