mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTA GGCAGTTATCCTGGCTATA CTGAAATGTTAAGAAGAGAGACCTTACCTGAAGTGAAGAGTCTTTGTTTATTAGCCAAGGATGACTTGCCTACATACCTTTCCTCCCACAAGGATATTATTTCTCTAATTTCCCTTTTGGGGTTGCTATGCTAGGCAGTTATCCTGGCTATATTGACAGGCTATTCCTCATCATGTTAGGCCTCTTCTTCTCATAGTTAT ACTCATCTAAAGGCATTCAAGAGAAACTGAAATGTTAAGAAGAGAGACCTTACCTGAAGTGAAGAGTCTTTGTTTATTAGCCAAGGATGACTTGCCTACATACCTTTCCTCCCACAAGGATATTATTTCTCTAATTTCCCTTTTGGGGTTGCTATGCTAGGCAGTTATCCTGGCTATATTGACAGGCTATTCCTCATCATGTTAGGCCTCTTCTTCTCATAGTTATGCCAAACATCAAACAAAATTCTCATCTTCTCATCAGTCCTCCTCCTCGACCCACCCTCATCTGCATGCCTGTGTCATGAGTGTCACAAGTGCATCCAATCCAAATTGCAGTGTTCACTTGAAAGGTACTTCTGATTATCAACTGTAGCTCACATTTTCATTTCCACAACATCAA 0 2 5' arm Solanum_torvum mirnest MIR169_5 0.0000008 tcc-MIR169g 0.0000002 -60.7 .....(((..((((((((...(((.((.(((((.(((.((((..((((...((((((.((((((((.(((((((((.......(((((.((((..((((......))))...)))).)))))....)))).)))))))))))))))))))....)))))))).)))))..))).)).))).))))))))..)))...... (-60.7)