mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCCCTTTGTCATCCTTTGCCT GCAGGGACAGCAAAGGGGTGC CTGGCCATGTGACTTGTGGGCTTCCCTTTGTCATCCTTTGCCTAGGGTTCTGAGAGGGGCAGGGACAGCAAAGGGGTGCTCAGTTGTCACCTCTCACAGC 3 1 5' arm Canis_familiaris mirbase mir-204 8e-36 mml-mir-211 5e-40 -41.32 (((.....(((((...(((((.(((((((((..(((((.((((.............)))))))))..))))))))).)))))...)))))......))). (-41.32)