mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TATGGAACGGAGGGAGTACAA ATACTCCCTCCGTTTCATATT AATCAAAGAATTATACTCCCTCCGTTTCATATTAAGTTAATTGTTAGGGAATTTTTGATGTTTCAAAATAAGTTAATTGTTAACTTTTCAAGGGATGTGTTGGAATTTTTTCCCAATTTTACCCTTCATTAATTAAGTTTCTAAGGTTGAGTTTTGTATAAGAAATAAATAATGCATTAAATGAATGTGTGAAGTTTGAAAAGGGTAAAAATGGAAAAACATGATTAAATTTTGTCTTTGTTTCTTTTTCTTAATATGTGTGAAATGACAACAATTAACTTAATATGGAACGGAGGGAGTACAAGAAAAACCA CGTATTGTGTTCCGAAAAGCAAAACTAATTATGAAGCACAATTACATTTAAAACGTACATTATCAGCCTCTTGGCTTTGGATACTTGATTGAGAGACTGGATTCAACTTTCCTTTGTCCTATACCCTCACCGTATAATTTCACAAACAAAACTATATTATAAACACCATTGAGAAAGGAATCAAAGAATTATACTCCCTCCGTTTCATATTAAGTTAATTGTTAGGGAATTTTTGATGTTTCAAAATAAGTTAATTGTTAACTTTTCAAGGGATGTGTTGGAATTTTTTCCCAATTTTACCCTTCATTAATTAAGTTTCTAAGGTTGAGTTTTGTATAAGAAATAAATAATGCATTAAATGAATGTGTGAAGTTTGAAAAGGGTAAAAATGGAAAAACATGATTAAATTTTGTCTTTGTTTCTTTTTCTTAATATGTGTGAAATGACAACAATTAACTTAATATGGAACGGAGGGAGTACAAGAAAAACCAGCAAATCATTTTGAGTGTTTGAGTACTCTGGATTCTTTCGATTTCCTGGTATCAGCTAAACATAGTTATTGACTCTTGTCCTCATCATAGTTAAAAGGCAGCGGCACAGACTTGAAGGCACGGTATTTTCCAACGTTATTCAAGTGCTCATTTTCCAACCTGAAAAAGTTCCAGATGCCTCGACGAAAGATTTCCAAACAGGCAACAACTGCAACGAATGCTTTCTTATGCAGAAATGGCAGTTCTTGAATATCTAGAACCAACTGCATCCATACTAGTCTCAGAATAATGTCAAGAACAATGGCAACAAAGTAGACAATCTTGTGTGGCACGAGTAGCTTGTCTCTCAACCAACGATTTTTGGAATTCCTTTGCAATAGACCCCAATCTATGACAAGGTCCCAATAAGTGTTTGCAACTGTAGTAACTCCTGAAGTTGATGCTGCCATTACTCTCCAAAAGGTTCCTCCCTTCT 1 0 3' arm Solanum_torvum mirnest MIR1122 0.00008 100 -79.9 ..........((.((((((((((((((((((((((((((((((((...(((.((((((....)))))).(((((((...)))))))))).(((((((.(((..((((((((.(((.((((((((((..((((((..........)))))).((((.....)))).(((((.(((((((.....)))))))...)))))..)))))))))).))).))))...)))).)))..)))))))...((..((((.((.....)).)))).)).)))))))))))))))))))))))))))))))).))......... (-79.9)