mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure AGCTACATCTGGCTACTGGGT TCAGTAGCCAGTGTAGATCC CCCTCAATGGCTCAGTAGCCAGTGTAGATCCTGTCTTTTGTAATCAGTAGCTACATCTGGCTACTGGGTCTCTGATGGCATCTTCTAGCT 2 1 3' arm Canis_familiaris mirbase mir-221 1e-28 bta-mir-222 3e-44 -38.7 ((.(((..(((((((((((((((((((...(((...........)))...))))).))))))))))))))..))).))............ (-38.70)