mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTGCATATGTAGGATGTCCCAT TGAACATCCTGCATAGTGCTGCC GCAGGGAGGTTGAACATCCTGCATAGTGCTGCCAGGAAATCCCTATTTTATACTAAGGGGGCTGGCTGGTTGCATATGTAGGATGTCCCATCTCCCCGCCCACTTCATCG 3 1 3' arm Canis_familiaris mirbase mir-448 2e-39 eca-mir-448 1e-43 -51.1 ((.(((((((.(.((((((((((((.(((.(((((..(..((((............))))..)..))))).))))))))))))))).).))))))).))........... (-51.10)