mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TAGCCAAGGATGACTTGCCTA GGCAGTCTCCTTGGCTATC GTTTGAAGAGAAAACGCCATACATGAAGATGAAGAGTCAATAAATGTTTAGTAGCCAAGGATGACTTGCCTACTCTTCTTTTCATCGTGGTAGTGAATCACCATGTAGGGGTAGGTAGGCAGTCTCCTTGGCTATCTTAATAGGCTCTTCTTTCTCATGCTCGGCTTTTACCTCTTTGTTTTTG GGGAATAAATTGAAGAGACTTGAAATCGTGGAAATGCAAGTAGTTTGAAGAGAAAACGCCATACATGAAGATGAAGAGTCAATAAATGTTTAGTAGCCAAGGATGACTTGCCTACTCTTCTTTTCATCGTGGTAGTGAATCACCATGTAGGGGTAGGTAGGCAGTCTCCTTGGCTATCTTAATAGGCTCTTCTTTCTCATGCTCGGCTTTTACCTCTTTGTTTTTGTCATATCTGTATGCATGATATATTTTGTATATGCGCTTCTATTTTTTTTAATATAGGTACTACATTGATTGCAGGCAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA 0 2 5' arm Tamarix_hispida mirnest MIR169_5 0.0000002 bna-MIR169i 0.0000000006 -66.7 ....((((((.(((.(((...(((((.((.((((((((......((((.((((((((((((.((((.(((((((..(((((.(((.(((((.....))))).))).)))))..))))))))))))))))))))).)).)))))))))))).)).)))))...))).)))..))))))....... (-66.7)