mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CAACCTGGAGGACTCCATGCTG CCATGGATCTCCAGGTGGGT AAAGTTCATTGTTCGACACCATGGATCTCCAGGTGGGTCACGTTTAGAGATACACCAACCTGGAGGACTCCATGCTGTTGA 2 2 3' arm Canis_familiaris mirbase mir-490 4e-37 bta-mir-490 9e-41 -32.6 ............((((((.(((((((((((((((.(((...(((....)))..))).)))))))))..)))))).)))))) (-32.60)