mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGAGTATTACATGGCCAATCTC GGTTGTCCATGGTGTGTTCATT AGTCAGGTACTTGAATGGAGGTTGTCCATGGTGTGTTCATTTTATTTATGATGAGTATTACATGGCCAATCTCCTTTCAGTACTAAATTCTTCTTGGG 3 0 3' arm Canis_familiaris mirbase mir-154 2e-33 eca-mir-496 1e-46 -35.5 .....((((((.(((.((((((((.(((((..(((((((((........)))))))))..))))).)))))))).))))))))).............. (-35.50)