mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGGAGCCAGGAAGTATTGATGT GTCAACACTTGCTGGTTTCCTC CAGTGGGGGAGCCAGGAAGTATTGATGTTTCTGCCAGTTTAGCGTCAACACTTGCTGGTTTCCTCTCTGGAGCATC 2 0 5' arm Canis_familiaris mirbase mir-505 1e-36 eca-mir-505 8e-38 -36.1 (((.(((((((((((.((((.((((((((...........)))))))).)))).))))))))))).)))....... (-36.10)