mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GGAATGTTGTTTGGCTCGAGG TCGGACCAGGCTTCATTCCCC TTTCTTTTGCGGGGAATGTTGTTTGGCTCGAGGTCACTAGAGAGCTTAGATCTCTCTCTCTATCTCTATCTCTATATACATCTATACATATAGATACAGATATATGTATCTATCTATGATGTTATAATTATGCTCAATTGGTCAACGGATCCAACATCCATGGTCTTTGTTGATTAATGAGCTTTAGATGAATCTTGATCGCTGGATCTGGTGTACTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTGTT ATTTTCATTTCACTCTCTCTTCATCAATTACCCTCTCTCATACATGTAGAGAATTGGAAGCTTTTTCTTTTGCGGGGAATGTTGTTTGGCTCGAGGTCACTAGAGAGCTTAGATCTCTCTCTCTATCTCTATCTCTATATACATCTATACATATAGATACAGATATATGTATCTATCTATGATGTTATAATTATGCTCAATTGGTCAACGGATCCAACATCCATGGTCTTTGTTGATTAATGAGCTTTAGATGAATCTTGATCGCTGGATCTGGTGTACTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTGTTGCTTTCACATTATATCTCTCGAAAGTCGTCATCTTTCTTTGAATAACAAAGATCCGATCTTGATCTTTAAGGTGGGTTTGTTTTTTACCCTGTATATTATTAACCTTTTGTGTTATCTTCTCTTTGTGTTTTTAAGGTTGCAGATTAGGTTAACCAGATGGGAAGTAAAAGACAGATTGGTGTAATGATTGAAAGTTTTGACCTACTTTAACTCTGCAAAATACCCAAAAAAAAAAAAAAAAAGGGTATCATATAATCATTACTCTTTGAGATCCGAAAACAAAGTAATCGATCAGAAGAATTTGTGTTTGTATCATTGTACATGAATTGATGAATACATGATTGTTTCAACTACAAAAAAAAAAAAAAAA 4 0 5' arm Taraxacum_kok-saghyz mirnest mir-166 0.000001 ptc-MIR166a 0.0000000002 -74 ......(((.((((((((..((((((.(((((..(((((((...((..((((........(((((.((....((((.(((((.(((...(((((((((......))))))))).))))))))))))..)).(((((.((((((((((((.(((.......)))..)))))))))))))))))...)))))......))))...)).)))))))..))))).))))))..)))))))).)))..... (-74)