mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GCGACCCACTCTTGGTTTCCA GAAATCCAGAGTGGGTAAGGCCT GGGGACTGCCAGGTGACCCTGGAAATCCAGAGTGGGTAAGGCCTGTCTGATTGTGTCTAGGCGACCCACTCTTGGTTTCCATGGTTGCCCTGGA 2 2 3' arm Canis_familiaris mirbase mir-551 6e-24 ptr-mir-551a 1e-31 -50.3 (....)..(((((..(((.((((((((.(((((((((...(((((.(.......).).)))).))))))))).)))))))).)))..).)))). (-50.30)