mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure GTTGTGTCAGTTTATCAAAC TTGATAAGCTGACATGGGACAG AAAGACCTGCTGTCCACAGTGTGTTTGATAAGCTGACATGGGACAGGGATTCTTTTCACTGTTGTGTCAGTTTATCAAACCCATACCTGGATGAC 0 2 3' arm Canis_familiaris mirbase mir-599 2e-36 mml-mir-599 3e-44 -37.8 ...........(((((..(((.(((((((((((((((((..((((((((.....))).)))))))))))))))))))))).)))...)))))... (-37.80)