mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCGGACCAGGCTTCATTCCCC GGAATGTTGTTTGGCTCGAGG TTCTTTTGCGGGGAATGTTGTTTGGCTCGAGGTCACTAGAGAGCTTAGATCTCTCTCTCTATCTCTATCTCTATATACATCTATACATATAGATACAGATATATGTATCTATCTATGATGTTATAATTATGCTCAATTGGTCAACGGATCCAACATCCATGGTCTTTGTTGATTAATGAGCTTTAGATGAATCTTGATCGCTGGATCTGGTGTACTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTGT ATTTTCATTTCACTCTCTCTTCATCAATTACCCTCTCTCATACATGTAGAGAATTGGAAGCTTTTTCTTTTGCGGGGAATGTTGTTTGGCTCGAGGTCACTAGAGAGCTTAGATCTCTCTCTCTATCTCTATCTCTATATACATCTATACATATAGATACAGATATATGTATCTATCTATGATGTTATAATTATGCTCAATTGGTCAACGGATCCAACATCCATGGTCTTTGTTGATTAATGAGCTTTAGATGAATCTTGATCGCTGGATCTGGTGTACTCGGACCAGGCTTCATTCCCCCCAATTGTTGCTTTCACATTATATCTCTCGAAAGTCGTCATCTTTCTTTGAATAACAAAGATCCGATCTTGATCTTTAAGGTGGGTTTGTTTTTTACCCTGTATATTATTAACCTTTTGTGTTATCTTCTCTTTGTGTTTTTAAGGTTGCAGATTAGGTTAACCAGATGGGAAGTAAAAGACAGATTGGTGTAATGATTGAAAGTTTTGACCTACTTTAACTCTGCAAAATACCCAAAAAAAAAAAAAAAAAGGGTATCATATAATCATTACTCTTTGAGATCCGAAAACAAAGTAATCGATCAGAAGAATTTGTGTTTGTATCATTGTACATGAATTGATGAATACATGATTGTTTCAACTACAAAAAAAAAAAAAAAA 3 0 3' arm Taraxacum_kok-saghyz mirnest mir-166 9.0E-7 ptc-MIR166a 8.0E-10 -74 .....(((.((((((((..((((((.(((((..(((((((...((..((((........(((((.((....((((.(((((.(((...(((((((((......))))))))).))))))))))))..)).(((((.((((((((((((.(((.......)))..)))))))))))))))))...)))))......))))...)).)))))))..))))).))))))..)))))))).))).... (-74)