mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCAAAGGGATCGCATTGATC TCATGTGATGTCTTTGGAAG CACTAGATTTGATTATGTTGCAGCAGGCGGAAGCTTCCAAAGGGATCGCATTGATCCGGTTTATTAGATGATGTGATTCATTCGTATTTGTTTCAGGATTATCCATCCATGGAAGCAACTCGATCTGAGATGATAATTAATAATTTGGATCATGTGATGTCTTTGGAAGTTTCCGTCAGTGTTTGCATTGATCTATCCATC CACACCACTAGATTTGATTATGTTGCAGCAGGCGGAAGCTTCCAAAGGGATCGCATTGATCCGGTTTATTAGATGATGTGATTCATTCGTATTTGTTTCAGGATTATCCATCCATGGAAGCAACTCGATCTGAGATGATAATTAATAATTTGGATCATGTGATGTCTTTGGAAGTTTCCGTCAGTGTTTGCATTGATCTATCCATCCGTCGCTCCAATTTCATTCAAAGCTCATGATTCCTTTTTCCCTCTCTTCTCTATAGTTACTGTGTGTAGCAACTTCGTCGATGCAAGAATTTGATCATATAAGGGGTTGTAGGCGTGAATGATTTTGTTTTGAAGATAATTGATCGAAAAAGATATTATATTCTGCGAGACAACTTGAACTAGATATTACGTATAACAAAGCATATATTCATGATTTAAACATGTAAAAAATGAAATTGTTTGTTAGGTTTTACATCATAGTTTAAACGATCAGATCTATGGTAGAAGGTTCATGTTATATGTGAATTATGATGTTGTCCATAAGGCGACGCAGATGGTACAGTTTTCTCGTACCTTTAATAATTATTTCAGTTAACTCTTTGTGCAAAAAAAAAAAAAAAAAA 1 1 5' arm Taraxacum_kok-saghyz mirnest 100 sbi-MIR393 0.0000002 -73.3 .....(((..(((((...((((((.((((((((((((((((((.(((((((.(((((((.(((((((.((...((.((((.(((...(((((((.((((.....))))...)))))))..)))..)))).)).)).))))))).)))))))))))))).)))))))))))))))))).))...)))).))))).))).... (-73.3)