mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAATGTAAAGAAGTATGTAT ACATACTTCTTTATGTACCCATA TACTCAGAGTACATACTTCTTTATGTACCCATATGAACATACAATGCTATGGAATGTAAAGAAGTATGTATTTTTGGT 1 1 3' arm Equus_caballus mirbase mir-1 2e-32 mdo-mir-1 5e-39 -27.74 .(((.(((((((((((((((((((((..(((((..............))))).))))))))))))))))))))).))) (-27.74)