mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAATGTAAAGAAGTATGTAT ACATACTTCTTTATATGCCCATA GCTTGGGAAACATACTTCTTTATATGCCCATATGGACCTGCTAAGCTATGGAATGTAAAGAAGTATGTATTTCAGG 2 1 3' arm Equus_caballus mirbase mir-1 1.0E-30 mml-mir-1-1 2.0E-35 -30.8 .((((..(.((((((((((((((((..((((((((.....)))...))))).)))))))))))))))).)..)))) (-30.80)