mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGGAAGACTAGTGATTTTGTTGT AACAAATCACAGTCTGCCATA TGGTCTAGTTCTGTGTGGAAGACTAGTGATTTTGTTGTTTGTAGATAACTAAATCGACAACAAATCACAGTCTGCCATATGGCACAGG 1 2 5' arm Equus_caballus mirbase mir-7 7e-36 ssc-mir-7 2e-42 -32.2 .......((.((((((((.(((((.(((((((.((((((..(((....)))....)))))))))))))))))).)))))))).))... (-32.20)