mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCTTTGGTTATCTAGCTGTATGA ATAAAGCTAGATAACCGAAAGTA TTGGTTGTTATCTTTGGTTATCTAGCTGTATGAGTGGTGTGGAGTCTTCATAAAGCTAGATAACCGAAAGTAAAAATAA 3 0 5' arm Equus_caballus mirbase mir-9 5e-24 mml-mir-9-1 1e-39 -29.1 ...(((.(((..(((((((((((((((.((((((.((.......)))))))).)))))))))))))))..))).))).. (-29.10)