mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TGTGCAAATCCATGCAAAACTGA AGTTTTGCAGGTTTGCATTTCAGC ACACTGCTACTTACGATTAGTTTTGCAGGTTTGCATTTCAGCGTATATATGTATATATGGCTGTGCAAATCCATGCAAAACTGATTGTGATAATGT 0 5 3' arm Equus_caballus mirbase mir-19 3e-29 mml-mir-19b-2 2e-42 -37.5 ..........(((((((((((((((((((((((((...((((.((((((....)))))))))))))))).)).)))))))))))))))))...... (-37.50)