mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCACAGTGGCTAAGTTCCGC AGGGCTTAGCTGCTTGTGAGCA CTGGGGAGCAGGGCTTAGCTGCTTGTGAGCAGGGTCCACACCGAGTCATGTTCACAGTGGCTAAGTTCCGCCCCCCG 3 1 3' arm Equus_caballus mirbase mir-27 5e-30 lca-mir-27a 3e-31 -43.4 ..((((.((.(((((((((..((.(((((((((.((......)).)).)))))))))..))))))))).)).)))). (-43.40)