mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TTCAACGGGTCTTTATTGAGCA CTCAATAAATGTTTGTTGAATT AACACAGTGGGCGCTCAATAAATGTTTGTTGAATTGAGATGCGTTAAATTCAACGGGTCTTTATTGAGCAACCACTCTGTG 3 0 3' arm Equus_caballus mirbase 100 ssc-mir-95 5e-36 -34.5 .(((.(((((..((((((((((..(((((((((((...........)))))))))))..))))))))))..))))).))). (-34.50)