mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACAGTACTGTGATAACTGAA CAGTTATCACAGTGCTGATGCT CTCAGTTATCACAGTGCTGATGCTGTCAGTTCTAAAGGTACAGTACTGTGATAACTGAA 1 1 3' arm Equus_caballus mirbase mir-101 2e-19 mdo-mir-101-1 5e-23 -31.4 .((((((((((((((((((.((((............)))))))))))))))))))))). (-31.40)