mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACAGTACTGTGATAACTGAA CGGTTATCATGGTACCGATGCT CCTTTTTCGGTTATCATGGTACCGATGCTGTATATCTGAAAGGTACAGTACTGTGATAACTGAAGAATGGTG 1 1 3' arm Equus_caballus mirbase mir-101 5e-27 mml-mir-101-2 2e-35 -28.4 ((((((((((((((((((((((.(.((((............))))).)))))))))))))))))))).)).. (-28.40)