mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TACTCCCTCCGTCCCAAATTA ATTTGGGACGGAGGTAGTATG AGAGATCTACTATGACTTATGAGGAATAGCTGCTTATTAATTACTCCCTCCGTCCCAAATTAATAGTCCACTTTTGACTTTTCAAAGTCTTATTCTTTCAACTTTGACCACATATAATATTGTTTATACTATACTCCGTATAATTTTTGATACAAAATATATAAATAGATTATGTTTTACATGTAAATTTTTATTGGTATAAGTTTCATTAAAAATTATATAACACAAAAAAAATTATTTATGGTCAAAGTTGAATAAACAAGACTTCAAAAAGTCCAAACTGAACTATTAATTTGGGACGGAGGTAGTATGATTTATCGGTTATTGAATCAAAGTTGTAGCCTTTATAT CCGGGGAACAGAAGATCAAATATCATACTCATGGCTGGGAAAGTGTTTGCTAGTGTTAAATTCATCTTACTGTTGTCCTTTCTTTCAGTTGGGACTTTGAGATCAGTTCATGCACAGAAAACTTGGTGTGTGGCGAAGCCATCGTCCAGCCTTGCGACTCTTTTAACAAATATAAATTTTGCATGCTCACAAGTGGACTGCGGTTGCTTGCAAAAGGGTGCGGTTTGTTCGACACCTGACAACATATTCAATCATGCTTCAGTAGCCATGAACTTGTACTACCAGTCTAAAGGAAGAAACGCTTGGAATTGTCACTTTGGAAACTCTGGTCTAATTACAGTTAGTGATCCAAGTTATGGAGGCTGTATGTATGCTTAGATTATCTACATGAAGTTAGAGATCTACTATGACTTATGAGGAATAGCTGCTTATTAATTACTCCCTCCGTCCCAAATTAATAGTCCACTTTTGACTTTTCAAAGTCTTATTCTTTCAACTTTGACCACATATAATATTGTTTATACTATACTCCGTATAATTTTTGATACAAAATATATAAATAGATTATGTTTTACATGTAAATTTTTATTGGTATAAGTTTCATTAAAAATTATATAACACAAAAAAAATTATTTATGGTCAAAGTTGAATAAACAAGACTTCAAAAAGTCCAAACTGAACTATTAATTTGGGACGGAGGTAGTATGATTTATCGGTTATTGAATCAAAGTTGTAGCCTTTATATATAGAAAGTTGTCTTGTAGTTTAGTCCATTTTGGTACTTGTAATTTCATGATGTAATGTTTGTTGCCAATATGTCTTTTTTATCGCCTGTC 1 0 5' arm Taraxacum_officinale mirnest MIR1122 0.0003 100 -101.9 .........(((((((((.(((..((((((((...((((..((((.(((((((((((((((((((((.((.(((.(((((((..(((((((.((..((((((((((((((...(((((.((.(((............((((((((((((((..((..(((((.((((((.(((((...)))))......)))))).)))))..))..)))))))))))))).....))).)).)))))...))))))))))))))..)).)))))))..))))))).))).)).))))))))))))))))))))).))))))))....))))))))...))))))))))))......... (-101.9)