mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure TCCCTGAGACCCTAACTTGTGA ACGGGTTAGGCTCTTGGGAGC TGCGCTCCTCTCAATCCCTGAGACCCTAACTTGTGATGTTTACCGTTTAAATCCACGGGTTAGGCTCTTGGGAGCTGCGAGTCGTGCC 2 1 5' arm Equus_caballus mirbase lin-4 4e-31 age-mir-125b-1 6e-42 -37.9 .((((..(((.((.((((.((((.(((((((((((..(((((.....))))).))))))))))).))))))))..)).)))..)))). (-37.90)