mature_miRNA miRNA* pre-miRNA EST_contig mismatches bulges arm species source_database RFAM_best_hit RFAM_lowest_evalue miRBase_best_hit miRBase_lowest_evalue folding_energy secondary_structure CTTTTTGCGGTCTGGGCTTGC AAGCCCTTACCCCAAAAAGTA TGGATCTTTTTGCGGTCTGGGCTTGCTGTTCCTCTCAACAGTAGTCAGGAAGCCCTTACCCCAAAAAGTATCT 4 0 5' arm Equus_caballus mirbase mir-129 8e-35 eca-mir-129a 5e-36 -29.6 .(((((((((((.(((..((((((.(((..(..((....))..).))).))))))..))).))))))).)))) (-29.60)